Für die Sechzehntelsfinals stossen die sieben Teams der Swiss PREMIUM LEAGUE ebenfalls hinzu. Ab dann kämpfen 32 Equipen im K.-O.-Modus um den Sieg im Schweizer Cup.

Schweizer Cup Frauen, Auslosung Hauptrunde:

Handball Grauholz (1.) – SG Muotathal/Mythen Shooters (1.)
HS Biel (2.) – SG Malters/Menznau (1.)
Handball Emmen (1.) – HSG Leimenthal (1.)
SG Uzwil/Fortitudo Gossau (2.) – Spono Nottwil 2 (SPL2)
TV Zofingen (2.) – BSV Borba Luzern 2 (2.)
SG Unterland (2.) – HC Arbon (2.)
Uni Bern Handball (2.) – Handball Wohlen (SPL2)
LC Brühl 3 (2.) – ZMC Amicitia Zürich (SPL2)

Offizielles Spieldatum ist der 13. Oktober 2010.

Freilos: Handball Emmen (2.), HC Crissier (2.), GTV Basel (2.), US Yverdon (2.), HC Rümlang-Oberglatt (2.), SG Ruswil/Wolhusen (1.), HV Olten (1.), BSV Borba Luzern (1.), BSV Stans (1.), DHB Rotweiss Thun 2 (1.), LK Zug 2 (1.), SG ATV/KV Basel (1.), BSC Wettingen/Siggenthal (SPL2), HV Herzogenbuchsee (SPL2), STV Willisau (SPL2), LC Brühl 2 (SPL2), SG Basel Regio (SPL2).